De twee-naturenleer gaat over de verhouding van het goddelijke en menselijke in de Persoon van Jezus Christus of God de Zoon. Deze kwestie hangt nauw samen met de leer van de goddelijke drie-eenheid en maakt er in feite deel van uit. De discussie ging over hoe men de verhouding van de Zoon ten aanzien van de Vader moest omschrijven.