Met het woord Kerk kan, naast het gebouw en het instituut, ook de christelijke geloofsgemeenschap bedoeld worden. In deze betekenis krijgt het woord een hoofdletter. In de loop van de geschiedenis zijn er vele conflicten geweest die tot vele Kerken (denominaties) hebben geleid.
Met het woord Kerk wordt meestal het hele kerkverband aangeduid, bijvoorbeeld bij de rooms-katholieken. Het Nederlandse onderdeel heet kerkprovincie, en de plaatselijke gemeenschap heet parochie.
In de protestantse traditie wordt het nationale kerkverband meestal met de term Kerk aangeduid. De plaatselijke geloofsgemeenschap heet gemeente.
In nog andere kerkverbanden (waaronder ook protestantse) wordt het overkoepelend kerkverband aangeduid met kerken en spreekt men plaatselijk van kerk. De Gereformeerde Kerken (vrijgemaakt) zijn hier een voorbeeld van.
Het onderdeel van de theologie dat zich bezighoudt met de Kerk, heet de ecclesiologie. Hier kent men begrippen als ware Kerk en de onzichtbare Kerk.